克莱沉吟片刻，点头道：“这个想法很好。不过这里面存在很大的问题。”
“什么问题？”
庞学林有些好奇道。
柏克莱道：“想要研究非编码rna在细胞内与其他非编码rna以及蛋白质之间的相互作用，我们就必须对蛋白质有一个非常深入的认知。特别是蛋白质的动态性与其内在功能的联系，必以我们目前实验室内的仪器，恐怕很那做到。”
“就拿蛋白质来说，虽然自二十世纪中期，血红蛋白的晶体结构被解析以来，我们已经知道了很多蛋白质及其复合物的空间结构，。特别是近年来，随着结构解析方法学的发展，特别是结构基因组学的兴起，我们可以通过晶体衍射、核磁共振、冷冻电镜等手段，大幅度加快了解析蛋白质的三维结构速度。”
“但是迄今为止，我们依然无法从蛋白质的一级序列去推断它的三维结构，更不能准确预测它的生物学功能，甚至在已知三维条件下也很难做到准确地认识蛋白质的功能。原因很简单，我们缺少对蛋白质时间维度的了解。蛋白质是具有一定空间结构的实体，其三维性质，如我们所熟知的疏水袋、套装环等，与它的生物功能紧密相关。”
“然而，在溶液中，蛋白质处于不断地运动和变化状态，在活细胞内，蛋白质又要经过折叠、修饰、转运和组装成复合物的过程。这种运动的时间尺度随不同蛋白质、同一蛋白质在不同环境、同一蛋白质的不同部位各不一样。例如，通常酶的活性部位的运动性比较大，而二级结构部位则较为刚性。因此，同蛋白质的三维结构一样，蛋白质的动态学特征在决定蛋白质功能的过程中具有同等重要的作用
第四百章 动态APT(2/8)